Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPIRE2Q8WWL2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIRE2Q8WWL2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE2Q8WWL2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms