Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf54Q8WWF1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms