Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RASGRP4Q8TDF6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RASGRP4Q8TDF6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms