Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROKR1Q8TCW9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROKR1Q8TCW9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROKR1Q8TCW9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms