Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTLL11Q8NHH1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL11Q8NHH1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms