Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF548Q8NEK5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF548Q8NEK5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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