Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIPK4Q8NE63 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIPK4Q8NE63 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms