Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP38Q8NB14 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP38Q8NB14 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP38Q8NB14 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms