Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TC2NQ8N9U0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms