Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHTF2Q8N3S3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHTF2Q8N3S3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHTF2Q8N3S3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms