Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1I0

DOCK4, Dedicator of cytokinesis protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOCK4Q8N1I0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DOCK4Q8N1I0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DOCK4Q8N1I0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DOCK4Q8N1I0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms