Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A6

C4orf33, UPF0462 protein C4orf33, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf33Q8N1A6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf33Q8N1A6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4orf33Q8N1A6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms