Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP2Q8IXW5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RPAP2Q8IXW5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms