Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP9

ZNF547, Zinc finger protein 547, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF547Q8IVP9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF547Q8IVP9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF547Q8IVP9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms