Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC50Q8IVM0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms