Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
P3H3Q8IVL6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
P3H3Q8IVL6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms