Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TREML1Q86YW5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREML1Q86YW5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms