Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
DZIP3Q86Y13 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DZIP3Q86Y13 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DZIP3Q86Y13 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DZIP3Q86Y13 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DZIP3Q86Y13 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DZIP3Q86Y13 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DZIP3Q86Y13 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DZIP3Q86Y13 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DZIP3Q86Y13 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DZIP3Q86Y13 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DZIP3Q86Y13 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DZIP3Q86Y13 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
DZIP3Q86Y13 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DZIP3Q86Y13 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms