Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM50Q86XT4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms