Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFR1Q86XK3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFR1Q86XK3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFR1Q86XK3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFR1Q86XK3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms