Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LCA5Q86VQ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCA5Q86VQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms