Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
N4BP2Q86UW6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms