Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF554Q86TJ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF554Q86TJ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF554Q86TJ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms