Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLNKQ7Z7G1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms