Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT25Q7Z3Z0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT25Q7Z3Z0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms