Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HS2ST1Q7LGA3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS2ST1Q7LGA3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms