Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPCAT2Q7L5N7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LPCAT2Q7L5N7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms