Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GDPD3Q7L5L3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDPD3Q7L5L3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms