Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMUB2Q71RG4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms