Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP43Q70EL4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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