Protein–RNA interactions for Protein: Q70E73

RAPH1, Ras-associated and pleckstrin homology domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPH1Q70E73 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAPH1Q70E73 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPH1Q70E73 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms