Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWJ1

STXBP4, Syntaxin-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STXBP4Q6ZWJ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STXBP4Q6ZWJ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STXBP4Q6ZWJ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
STXBP4Q6ZWJ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STXBP4Q6ZWJ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STXBP4Q6ZWJ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STXBP4Q6ZWJ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STXBP4Q6ZWJ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STXBP4Q6ZWJ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STXBP4Q6ZWJ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STXBP4Q6ZWJ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
STXBP4Q6ZWJ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STXBP4Q6ZWJ1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms