Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS12Q6ZW61 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms