Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAXIP1Q6ZW49 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAXIP1Q6ZW49 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAXIP1Q6ZW49 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAXIP1Q6ZW49 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PAXIP1Q6ZW49 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PAXIP1Q6ZW49 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PAXIP1Q6ZW49 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms