Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00299Q6ZSB3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms