Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS17

RIPOR1, Rho family-interacting cell polarization regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR1Q6ZS17 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPOR1Q6ZS17 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPOR1Q6ZS17 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPOR1Q6ZS17 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPOR1Q6ZS17 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPOR1Q6ZS17 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPOR1Q6ZS17 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPOR1Q6ZS17 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPOR1Q6ZS17 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPOR1Q6ZS17 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR1Q6ZS17 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms