Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF111Q6ZNA4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms