Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA5Q6ZMJ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCARA5Q6ZMJ2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms