Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LBX2Q6XYB7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LBX2Q6XYB7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms