Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD4Q6W3E5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDPD4Q6W3E5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms