Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TFAP2EQ6VUC0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TFAP2EQ6VUC0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms