Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXX9

RSPO2, R-spondin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO2Q6UXX9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RSPO2Q6UXX9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPO2Q6UXX9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms