Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCBE1Q6UXH8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCBE1Q6UXH8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms