Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM198BQ6UWH4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM198BQ6UWH4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms