Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATRAIDQ6UW56 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms