Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCD3Q6STE5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SMARCD3Q6STE5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms