Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZBED9Q6R2W3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms