Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC174Q6PII3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms