Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC12Q6PEW1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms