Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.31■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.27■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REEP3Q6NUK4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP3Q6NUK4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms